Databáze GlobalAMFungi je unikátní databází arbuskulárně mykorhizních (AM) hub. AM houby žijí v symbióze s kořeny rostlin a pomáhají jim získávat živiny a odolávat stresu. Databáze, obsahující DNA sekvence AM hub z více než 8 tisíc vzorků kořenů a půdy z celého světa, je volně přístupná a obsahuje informace o rozšíření druhů AM hub, hostitelských rostlinách a podmínkách prostředí, kde se vyskytují.
Více na https://globalfungi.com/
K dalšímu čtení v Živě
Symbióza, kam se podíváš. O arbuskulárně mykorhizních houbách a soužití s rostlinami (2017, 5)
Může arbuskulární mykorhiza pomoci v zemědělské produkci? (2017, 5)
Živá půda 8. Interakce půdních organismů a rostlin (2017, 5)
Další podrobnosti k tématu lze najít v článku
VĚTROVSKÝ, Tomáš, et al. GlobalAMFungi: a global database of arbuscular mycorrhizal fungal occurrences from high‐throughput sequencing metabarcoding studies. New Phytologist, 2023, 240.5: 2151-2163.
The GlobalAMFungi database is a unique database of arbuscular mycorrhizal fungi (AMF). These fungi live in symbiosis with plant roots, aiding nutrient absorption and stress tolerance. The database contains DNA sequences from over 8 000 root and soil samples from all over the world. Freely accessible, it provides information on AMF species distribution, host plants, and environmental conditions.
-
Životní cyklus arbuskulární myko rhizní (AM) houby. Ze spor vyrůstají houbová vlákna (hyfy), ta se mohou větvit, prorůstat půdou a vstupovat do kořenů hostitelské rostliny. Zde vlákna kolonizují mezibuněčné prostory, vstupují do buněk a vytvářejí vezikuly (v obr. nejsou zakresleny) nebo arbuskuly. Mycelium poté prorůstá ven do půdy, kde se na něm vytvářejí spory. Blíže v textu. Převzato z článku: K. Akiyama (2007), s laskavým svolením autora, legenda upravena
-
Spory AM hub se pro určení druhu rozmáčknou na podložním skle a barví specifickými činidly pro zvýraznění struktury jejich stěn. Diversispora epigaea – na místě prasknutí spory lze pozorovat strukturu stěn a olejové kapénky, které původně sporu vyplňovaly. Foto M. N. Marascalchi
-
Spory AM hub se pro určení druhu rozmáčknou na podložním skle a barví specifickými činidly pro zvýraznění struktury jejich stěn. Funneliformis mosseae – charakteristickým znakem tohoto rodu je nálevkovité připojení houbového vlákna ke spoře. Načervenalé zbarvení je reakce nejsvrchnější vrstvy spory na Melzerovo činidlo. Foto M. N. Marascalchi
-
Rhizophagus manihotis – vnější hyalinní stěna spory má granulární strukturu, proto snadno praská. Foto M. N. Marascalchi
-
U druhu Rhizophagus manihotis se spory často tvoří i uvnitř kořenů. Foto M. N. Marascalchi
-
Sbírka čistých kultur AM hub ve skleníku Oddělení mykorhizních symbióz Botanického ústavu AV ČR. AM houby nerostou bez kořenů hostitelských rostlin, proto je nutné je pěstovat s univerzálním hostitelem. V popředí kukuřice setá (Zea mays), vzadu stužkovec Desmodium heterocarpon subsp. ovali folium. Foto D. Püschel
-
Úvodní strana GlobalAMFungi (https://globalamfungi.com). Mapa ukazuje geografický původ všech vzorků, které jsou v současné době v databázi. Jednotlivé vzorky znázorněny barevnými kolečky
-
Grafy průměrné roční teploty stanovišť, na kterých byly odebrány vzorky s cílovým druhem AM houby. Z porovnání s grafem pro všechny vzorky v GlobalAMFungi databázi vidíme, že Rhizophagus manihotis byl nalezen na teplejších místech, naopak Diversispora epigaea na místech chladnějších. Funneliformis mosseae nevykazuje zřejmé teplotní preference. Orig. Z. Kolaříková
-
Screenshot uživatelského rozhraní databáze GlobalAMFungi po zobrazení vzorků, ve kterých byla nalezena houba Funneliformis mosseae. Po zvolení nabídky/záložky Metadata se zobrazí souřadnice stanovišť, kde byly vzorky odebrány, průměrná teplota, průměrné množství srážek, pH půdy, hostitelská rostlina, rok odběru, typ biomu, atd.
-
Screenshot uživatelského rozhraní databáze GlobalAMFungi po zobrazení vzorků pocházejících z České republiky. Na mapě vidíme přesné lokality vzorků, ve spodní části je seznam nalezených druhů AM hub.
